股改在诸多方面具有划时代的意义，但仅仅是开了一个头，指明了方向。由于没有长远的规划、各项配套措施也跟不上，导致后续市场化行为在跟国际接轨的过程中留下了很多后遗症，最突出的一点就是大小非减持，对沪深两市造成了巨大的下行压力。
对大小非减持缺乏规划
股改时缺乏长远规划，使得各路大小非减持常常集中于某一个月，整个过程呈无序状态。此举不但大大逆转了股市的供求关系，而且还让股市的估值体系遭到了挑战。同时，草率进行的新老划断，形成了大量解禁股，且在解禁时间上既集中又重合，一旦全部解禁上市，市场一时是难以承受的。从公开的历史数据来看，截至2008年7月底，沪深两市累计产生股改限售股份数量为4621.04亿股，未解禁股改限售股份存量3741.10亿股。假设当时每股平均价格为10元，需要4621亿的资金才能消化。
此外，对于大小非到底应该怎么减持，减持的价格怎么样，对市场的价格影响怎么样。这些问题在股改时既没有考虑，也没有想办法解决，把这一的难题整体向后推移了三年。
2008年在实现全流通后，国内多位经济学家对股改的得失进行了总结。李迅雷（现任海通证券首席经济学家）认为，当时我们对全流通股票改革缺乏充足的经验，但股改还没完成，不能说失败。著名经济学家韩志国说，股改的大方向是正确的，但是弊端和失误也存在。难怪有业界人士调侃为“步子太大，扯到了蛋”。
减持重创了大盘
要将过去十几年时间累计的大小非问题要在短短几年左右的时间让市场来完全消化，这是非常困难的，也对市场的冲击和压力是非常大的。记者统计了自2008年以来的两市重要股东在二级市场的减持数据（参见图1）。
数据显示，除今年外，重要股东的减持额度一直呈稳定上升态势，即便在行情低迷的2008年，减持额仍然高达552.95亿；2009年，随着大盘幅度反弹，减持达到了疯狂状态，全年减持了985.91亿。截止今年11月2日（上周末）以来，力度略稍有所减弱，但减持额度仍达531.29亿。5年来，两市重要股东的减持额总计达3491.14亿元。对绵绵阴跌的大盘造成了极大压力。
就个股而言，限售股解禁数量越大，对股价的短期冲击越明显，以海通证券（600837）为例，2008年11月21日12.89亿股解禁，当天在大宗交易现身16次，合计成交约1.4亿股。随后4个交易日出现三个跌停板，跌幅高达37%。而这种现象在过去几年屡见不鲜，给二级市场的投资者带来了巨大损失。