据台湾媒体报道，7月11日，国民党中常会中常委邱毅建议删除高中历史教科书中“皇民化”、“台独化”等不宜的内容，获国民党主席马英九认同。他表示，其办公桌上现正放着一叠即将出版的高中历史教科书，他看了也觉得很荒谬，内容严重违反“宪法”。这一新闻可视为马英九对争议多时的高中历史教科书内容最明确的宣示。
历史教育是塑造民族认同与国家认同的重要手段，任何一个国家在塑造其民族认同与国家认同时，历史教育和历史教科书所扮演的角色，都是无可取代的。亦如清代思想家龚自珍所言：“灭人之国，先去其史。”台湾自李登辉执政以来，“台独”势力利用执政资源，以推动教改为名，以“台湾主体意识”为掩护，强力修改历史教科书，将台湾与大陆分割开来，实行“去中国化”的“台独”教育。从初中“认识台湾”教科书的启用，到“台独”分子杜正胜“同心圆理论”的提出并成为“九年一贯”课程中历史教育的主纲，再到高中教科书“台湾史”独立成册，台湾学子的历史教育已经面目全非，也一直被社会各界强烈诟病。
台湾历史教科书经过十几年来“台独”的改造，可说问题重重，诚如邱毅在国民党中常会中所说，“内容充满‘皇民化’与‘台独化’的思想”。其最突出者有四：
一日割裂。把“台湾史”与“中国史”完全分裂，妄图切断台湾与大陆的历史联系。
二日顺序。依照杜正胜“同心圆”的设计，课程实施的顺序为：台湾史——中国史——世界史。为了政治主张，强迫学生一头栽进迷雾。台湾著名学者许倬云教授曾指出，这种安排最为欠妥，这是一个不讲来龙去脉的安排。
三日压缩。在大幅增加台湾史的同时，减少中国史，把五千年中国史缩小到只有一学期、一册教科书。台湾师大东亚系潘朝阳教授曾说过，这种课程结构的设计，自然会产生这样的教育效果：五六千年丰厚的中国历史一方面已被大量缩减删除，一方面又以“外国史”对待，在既外化且又淡漠地认知中国史情形下，台湾学子很自然将以台湾为独立体而通向世界，这中间没有中国认同。
四日荒谬。教科书内容之荒谬之处不胜枚举，如清代台湾用“清领”，“日据”台湾用“日治”，“光复”用“战后”，抗战胜利用“终战”等等。
因此，台湾各界都强烈希望台当局能在教科书问题上拨乱反正。教科书误人子弟，影响两岸关系和平发展甚巨。诚如台湾文化大学历史系教授王仲孚所云：“消灭青少年的历史记忆，改变青少年历史认同，是罪恶的行为。”台湾教科书拨乱反正，实在已是刻不容缓。