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摘要 中医基础理论源远流长，在中医学中尤其重要，作为一个整体的系统，对其进行全面、证据性的诠释显得尤其重要。系统药理学方法（TCMSP）用于分析中医基础理论，旨在了解中医基础理论的内涵和TCMSP的应用，是一个从整体和系统的角度研究中医分子机制的方法，可以解释复杂中医的现代医学基础理论。通过针对TCMSP与其在中医基础理论中的应用展开研究，分析具有代表性的研究案例，旨在为该方法在中医基础理论的诠释研究提供参考。
关键词 TCMSP;中医基础理论;系统水平;中药性能，归经理论;气血理论;病机制论;文章汇总
Abstract Objective：Systematic pharmacology（TCMSP）is used to analyze the basic theory of traditional Chinese medicine，aiming to understand the connotation of basic theory of Chinese medicine and the application of TCMSP.Methods：The research on TCMSP and its application in the basic theory of traditional Chinese medicine was carried out，and representative research cases were cited for analysis.Results：The basic theory of traditional Chinese medicine had a long history and was especially important in traditional Chinese medicine.It was especially important to carry out comprehensive and evidentiary interpretation.Conclusion：The theory of TCM and its system as a whole cannot be studied from a certain point or a certain aspect.TCMSP is a molecular mechanism for studying TCM from a holistic and systematic perspective，which can explain the basic theories of modern medicine in complex Chinese medicine.
Key Words TCMSP; Basic theory of Chinese medicine; System level; Chinese medicine performance; Channel tropism theory; Qi and blood theory; Pathogenesis theory; Summary of the articles
中圖分类号：R22;R285.1 文献标识码：A doi：10.3969/j.issn.1673-7202.2019.10.018
在医学领域中有着几千年历史的中药（Traditional Chinese Medicine，TCM）不断为人类的健康事业做出巨大的贡献，然而中药尚不明确的作用机制限制了中药在国内外更广泛地传播与发展，探讨系统药理学在中药作用机制解析上的研究进展，可以消除人们对中药使用的顾虑。同时，中医理论作为一个整体的系统，其研究不能简单地从某一点或某一方面入手。TCMSP是一个从整体和系统的角度研究中医的分子机制，可以解释复杂中医的现代医学基础理论。
1 系统药理学
1.1 系统药理学的概念 人体是一个复杂的生物网络系统，该系统包括代谢网络、信号网络、蛋白质相互作用网络和基因调控网络。如果认为疾病已经改变了身体的原始网络平衡，那么使用药物的目的就是使身体恢复到其原始平衡状态。特别是对于复杂的疾病，例如癌症和心血管疾病这些多由于生活习惯或遗传引起的一系列疾病，由于生物网络的复杂性和稳定性，通常同时调整网络系统中的多个节点以实现期望的治疗效果”。单药-单靶点-单疾病”的治疗方式往往出现局限性。药物倾向于与靶标相互作用以形成富集的网络而不是孤立的一对一对应。针对多靶标/器官相互作用寻找新型疗法来预防和治疗疾病成为人们治疗复杂疾病正在努力的方向[1]。有趣的是，中药就是这样一个满足以上要求的多组分，多靶点的协同系统。
中医强调人体的完整性。中医认为，人体是一个有机整体，构成人体的各种成分在结构上是不可分割的。在功能方面，它们相互协调，相互补充，在病理学上也相互影响。自2000年以来，已有大量有效的中药复方用于治疗各种疾病，如丹逍遥散，柴胡疏肝散，复方丹参等;中医药现代化研究也已有20余年的时间。中医不仅是中华文明的重要载体，而且在人民健康事业中也发挥着独特的作用。党和国家已经逐渐开始将中医药事业发展摆在党和国家事业发展全局中的战略性地位。中国共产党十八大以来，以习近平同志为核心的党中央，坚持中西医学的重要性，不断推动中医药的振兴和发展。
中医是具有独特整体特色的民族医药，取得了令人瞩目的成就。但是，由于中药成药过程缺少西药中的系统药物发现过程，针对中药的深入研究过程往往面临着许多问题，如中药基础理论的现代医学解释。对于中医药学整体性以及中药重要概念缺乏证据性诠释使得中医药的不断发展和走向世界受到了挑战。为了更加新进，合理且符合中医药的特点，中医药的基础理论和化合物的研究需要进一步研究。
随着计算机技术的发展，多学科整合分析成为了可能，将中医学与计算机技术结合起来的系统药理学（Systems Pharmacology）有望克服传统中药研究的弊端。作为一个新兴的交叉学科，系统药理学整合了系统生物学和药理学的方法来促进新药发现发展和对中药治疗机制的理解，从系统层面研究药物和身体功能的规律和机制，包括计算机科学、生物信息学、生物化学、药理学、结构生物学、基因组学和病理学等方面的知识和方法，同时也与实验相联系[2]。系统药理学认为药物产生的药理学效应是通过诱导生物体中生物大分子相互作用网络发生改变所产生的，不仅仅是由于特定的药物—靶标相互作用。药物发挥药理学效应过程中所产生的相互作用网络包括成分-靶点、靶点—代谢通路网络等，这些网络可以在细胞，组织，器官甚至整个生物体的水平上发生。系统药理学是使用生物信息学和统计学技术整合，并解释这些网络从而达到从系统水平上阐释药物产生药理学效应的过程。